跨地区直营连锁企业，即连锁店由总部全资或控股，在总部统一领导下经营的连锁企业，凡采用计算机联网、统一采购配送商品、统一核算、统一规范管理和经营，符合下列条件的，可由总公司向当地税务机关申报缴纳增值税。

一、本省(自治区、直辖市、计划单列市)范围内的连锁经营企业，由省(自治区、直辖市、计划单列市) 税务局会同同级财政局审批；

二、在县(市)范围内的连锁企业，由县(市) 税务局会同同级财政局审批上报。

自愿连锁企业，即门店为各自资产所有权不变的独立法人的连锁企业，特许连锁企业，即门店与总部签订合同并取得特许经营权，使用总部开发的商标、商号、经营技术、销售商品的企业，由独立核算门店向当地税务机关申报缴纳增值税。